記者近日從中國科學(xué)院西北高原生物研究所獲悉,該研究所研究員張同作聯(lián)合青海大學(xué)副教授魏青等團隊,成功組裝藏羚染色體級別的基因組,獲得藏羚染色體水平的高質(zhì)量基因組和注釋信息。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《自然》旗下綜合性科學(xué)期刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》上。

藏羚是國家一級保護動物,主要分布在青海可可西里、西藏羌塘、新疆阿爾金山等自然保護區(qū),在維持青藏高原生態(tài)系統(tǒng)平衡中具有重要作用,是研究高海拔適應(yīng)性機制和遷徙行為的良好模型。但目前公開數(shù)據(jù)庫中仍缺少藏羚高質(zhì)量的染色體水平基因組,嚴(yán)重限制了基于遺傳特征解析其物種適應(yīng)、進化及種群生態(tài)相關(guān)工作的開展。

這是藏羚基因組的組裝和注釋結(jié)果。(受訪單位供圖)

通過多種測序技術(shù),研究團隊成功組裝了藏羚染色體級別的基因組。張同作表示,數(shù)據(jù)評估表明組裝的連續(xù)性好,完整度和準(zhǔn)確性高;藏羚基因組中重復(fù)序列注釋結(jié)果表明,藏羚基因組重復(fù)序列總長度為1.65GB,占基因組的52.47%,同時在藏羚基因組上共注釋到28330個功能基因。

張同作介紹,此次成功組裝藏羚染色體級別的基因組,將為藏羚的適應(yīng)進化遺傳機制、保護遺傳學(xué)研究及進一步探索物種遷徙行為的遺傳機制提供重要基因組資源。(記者陳杰)

來源: 新華社

標(biāo)題:我國科學(xué)家公布藏羚染色體水平高質(zhì)量基因組

地址:http://www.17168cn.cn/paobuji/353935.html